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云南省兽医防疫总站位于云南省省会城市——美誉为春城的昆明市鼓楼路118号。云南省兽医防疫总站最早为1951年1月成立的云南省兽医防治所，1959年因机构改组被撤消；1963年，在云南省兽医防治所的基础上成立云南省兽医防疫大队，1965年并入云南省农业厅畜牧处；1974年3月，云南省革委会决定恢复云南省兽医防疫队，1978年更名为云南省畜牧兽医总站，1983年又更名为云南省兽医防疫总站至今。 云南省兽药监察所和云南省饲料监察所与云南省兽医防疫总站合署办公。 根据云南省人民政府云政发[2006]78号文件和云南省机构编制委员会办公室云编办[2006]96号文件精神2007年5月云南省兽药监察所、饲料监察所撤消后，新组建云南省动物卫生监督所。
一、单位职责及业务范围
1、协助兽医行政主管部门拟定有关法律、法规和政策建议；负责全省动物防疫的监督、动物产品安全和兽药监管等执法工作；
2、实施全省动物及动物产品检疫和管理、动物及动物产品生产、加工、流通等环节的监督及违法违规行为的查处；
3、行使有关《中华人民共和国动物防疫法》等法律法规规定的审批权、处罚权和行政强制措施权；
4、负责全省官方兽医、监督员、检疫员的管理。
5、负责基层兽医执法体系及队伍建设管理。负责动物卫生监督执法人员培训，相关法律法规的宣传贯彻。
6、负责全省检疫及防疫监督执法的证、照、章、标志、标识的计划、订购、发放及监管。
7、负责动物卫生监督信息报告，承担动物标识管理、动物和动物产品溯源工作；指导、监督全省动物卫生监督机构及公（铁）路动物防疫临时监督检查站的业务工作。
8、承担动物养殖、经营及动物产品生产、加工、流通、动物诊疗等场所动物防疫条件审核和监督工作，以及执业兽医的相关工作。
9、承担省农业厅交办的其它工作。
二、内设机构
根单位职责和业务范围，云南省动物卫生监督所内设5个科室：办公室、执法稽查科、检疫科、信息科、综合执法科。
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